嗜肺軍團菌(Legionella pneumophila)是一種典型的水傳染病原菌，存在十自然水環境和人工水係統(給水係統、冷卻水係統、醫院、賓館、療養院、遊泳池及溫泉浴場)。自1976在美國的Philadelphia爆發軍團病以來，水係統中的Legionella pneumophila也成為人們關注的焦點。有文獻報導，Legionella pneumophila對氯的抵抗力很強，2-6mg/L的持續投氯量和20-50mg/L的周期性衝擊加氯，才能抑製其在水中的繁殖，但如此高的加氯量勢必會造成配水管道的嚴重腐蝕和DBPs的大量生成。加熱也可以去除嗜肺軍團菌，但作用是暫時的，經過一段時間後嗜肺軍團菌會重新繁殖。
UV對嗜肺軍團菌有較強的滅活能力。ZemingLiu等研究了UV對醫院供水配水係統中Legionella pneumophila的滅活，發現試驗之前對係統管道進行預處理(熱水衝刷、加氯消毒)非常重要，而且UV消毒係統之前的過濾單元對維持UV強度的穩定也非常關鍵。Kumiko Oguma等人的研究表明，嗜肺軍團菌具有相當強的光活化能力。